- Formar Maestros en Biotecnología de alta calidad académica, capaces de desarrollar investigación, docencia y labores de vinculación y difusión científica, orientados a la solución de problemas en producción vegetal, de alimentos, ambiental y en materia de bioenergéticos.
- Atender y responder a las necesidades del país, de la región sur y, particularmente del Estado de Chiapas.
- Promover la difusión y divulgación de los conocimientos en el área de la biotecnología.